MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus 04-02981 chromosome

Total Repeats: 55314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017340	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149189
2	NC_017340	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387149189
3	NC_017340	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387149189
4	NC_017340	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387149189
5	NC_017340	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149189
6	NC_017340	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387149189
7	NC_017340	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387149189
8	NC_017340	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387149189
9	NC_017340	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	387149189
10	NC_017340	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387149189
11	NC_017340	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149189
12	NC_017340	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	387149189
13	NC_017340	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	387149189
14	NC_017340	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387149189
15	NC_017340	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387149189
16	NC_017340	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149189
17	NC_017340	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149189
18	NC_017340	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149189
19	NC_017340	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149189
20	NC_017340	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387149189
21	NC_017340	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149189
22	NC_017340	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387149189
23	NC_017340	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387149189
24	NC_017340	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149189
25	NC_017340	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149189
26	NC_017340	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387149189
27	NC_017340	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	387149189
28	NC_017340	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	387149189
29	NC_017340	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149189
30	NC_017340	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387149189
31	NC_017340	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	387149189
32	NC_017340	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	387149189
33	NC_017340	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	387149189
34	NC_017340	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149189
35	NC_017340	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387149189
36	NC_017340	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	387149189
37	NC_017340	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	387149189
38	NC_017340	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149189
39	NC_017340	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149189
40	NC_017340	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	387149190
41	NC_017340	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149190
42	NC_017340	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149190
43	NC_017340	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387149190
44	NC_017340	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149190
45	NC_017340	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387149190
46	NC_017340	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	387149190
47	NC_017340	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	387149190
48	NC_017340	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	387149190
49	NC_017340	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149190
50	NC_017340	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	387149190
51	NC_017340	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	387149190
52	NC_017340	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149190
53	NC_017340	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387149190
54	NC_017340	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	387149190
55	NC_017340	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149190
56	NC_017340	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387149190
57	NC_017340	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	387149190
58	NC_017340	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149190
59	NC_017340	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387149190
60	NC_017340	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	387149190
61	NC_017340	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149190
62	NC_017340	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387149190
63	NC_017340	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149190
64	NC_017340	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149190
65	NC_017340	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387149190
66	NC_017340	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387149190
67	NC_017340	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149190
68	NC_017340	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387149190
69	NC_017340	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	387149190
70	NC_017340	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	387149190
71	NC_017340	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	387149190
72	NC_017340	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149190
73	NC_017340	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149190
74	NC_017340	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387149190
75	NC_017340	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387149190
76	NC_017340	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	387149190
77	NC_017340	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149191
78	NC_017340	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149191
79	NC_017340	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149191
80	NC_017340	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149191
81	NC_017340	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387149191
82	NC_017340	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	387149191
83	NC_017340	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	387149191
84	NC_017340	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	387149191
85	NC_017340	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149192
86	NC_017340	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	387149192
87	NC_017340	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387149192
88	NC_017340	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	387149192
89	NC_017340	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149192
90	NC_017340	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387149192
91	NC_017340	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387149192
92	NC_017340	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387149192
93	NC_017340	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387149192
94	NC_017340	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	387149192
95	NC_017340	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387149192
96	NC_017340	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149192
97	NC_017340	TGT	2	6	4570	4575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387149192
98	NC_017340	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149192
99	NC_017340	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149192
100	NC_017340	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387149192
101	NC_017340	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149192
102	NC_017340	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149192
103	NC_017340	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149192
104	NC_017340	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149192
105	NC_017340	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387149193
106	NC_017340	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	387149193
107	NC_017340	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	387149193
108	NC_017340	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387149193
109	NC_017340	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387149193
110	NC_017340	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	387149193
111	NC_017340	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387149193
112	NC_017340	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387149193
113	NC_017340	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387149193
114	NC_017340	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387149193
115	NC_017340	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	387149193
116	NC_017340	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387149193
117	NC_017340	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	387149193
118	NC_017340	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149193
119	NC_017340	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387149193
120	NC_017340	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	387149193
121	NC_017340	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149193
122	NC_017340	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149193
123	NC_017340	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149193
124	NC_017340	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387149193
125	NC_017340	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149193
126	NC_017340	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387149193
127	NC_017340	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149193
128	NC_017340	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	387149193
129	NC_017340	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149193
130	NC_017340	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149193
131	NC_017340	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387149193
132	NC_017340	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387149193
133	NC_017340	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	387149193
134	NC_017340	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387149193
135	NC_017340	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149193
136	NC_017340	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	387149193
137	NC_017340	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	387149193
138	NC_017340	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	387149193
139	NC_017340	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149193
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141	NC_017340	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149193
142	NC_017340	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	387149193
143	NC_017340	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	387149193
144	NC_017340	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387149193
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149	NC_017340	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	387149194
150	NC_017340	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387149194
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152	NC_017340	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387149194
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156	NC_017340	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	387149194
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158	NC_017340	TAAG	2	8	7597	7604	50 %	25 %	25 %	0 %	387149194
159	NC_017340	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387149194
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161	NC_017340	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	387149194
162	NC_017340	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149194
163	NC_017340	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387149194
164	NC_017340	A	6	6	7828	7833	100 %	0 %	0 %	0 %	387149194
165	NC_017340	TCGT	2	8	7843	7850	0 %	50 %	25 %	25 %	387149194
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171	NC_017340	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149194
172	NC_017340	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387149194
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174	NC_017340	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149194
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238	NC_017340	ATT	2	6	10978	10983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149196
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247	NC_017340	TAT	2	6	11286	11291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387149196
248	NC_017340	CAA	2	6	11305	11310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387149196
249	NC_017340	CT	3	6	11313	11318	0 %	50 %	0 %	50 %	387149196
250	NC_017340	TAGCAT	2	12	11354	11365	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387149196
251	NC_017340	GAA	2	6	11398	11403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149196
252	NC_017340	TA	3	6	11521	11526	50 %	50 %	0 %	0 %	387149196
253	NC_017340	AGA	2	6	11532	11537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149196
254	NC_017340	TGC	2	6	11562	11567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387149196
255	NC_017340	ATG	2	6	11612	11617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149196
256	NC_017340	ACG	2	6	11695	11700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387149196
257	NC_017340	CGTTG	2	10	11735	11744	0 %	40 %	40 %	20 %	387149196
258	NC_017340	AATG	2	8	11811	11818	50 %	25 %	25 %	0 %	387149196
259	NC_017340	GGT	2	6	11875	11880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387149196
260	NC_017340	ATC	2	6	11915	11920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387149196
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262	NC_017340	GAT	2	6	12045	12050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387149196
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264	NC_017340	AAG	2	6	12140	12145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387149196
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